После того, как завершились проверки систем и отсеков корабля на герметичность в модернизированной вакуумной камере, «Союз МС-13» был перевезён и установлен в испытательный стенд, где провели завершающие проверки систем корабля. После этого корабль перевели в режим хранения до начала заключительного этапа подготовки к запуску.
Запуск транспортного пилотируемого корабля «Союз МС-13» к Международной космической станции запланирован на 20 июля 2019 года с космодрома Байконур. Корабль должен доставить на МКС экипаж в составе Александра Скворцова (командир, Роскосмос), Луки Пармитано (бортинженер, ЕКА) и Эндрю Моргана (бортинженер, НАСА).